MALDI-TOF MS: качественный прорыв в микробиологической диагностике

MALDI-TOF MS-анализу не подлежат

Аналит для MALDI-TOF MS-анализа – это

• белки;
• липиды;
• полипептиды;
• полисахариды;
• соли

Аналитом для MALDI-TOF MS-анализа в рамках микробиологической диагностики могут служить

• адсорбированная на поверхности микропористого фильтра бактериальная (грибковая) масса;
• исследуемая смесь электронейтральных молекул органических веществ и биополимеров;
• организованный консорциум микроорганизмов в естественных условиях существования;
• совокупность биологически активных молекул цитоплазмы бактериальной клетки;
• совокупность изолированных колоний на поверхности плотной питательной среды

Белковый паттерн – это набор графических символов, соответствующих

• исследуемый биологический материал;
• материал изолированной колонии;
• материал препарата для световой микроскопии;
• материал чистой агаровой культуры;
• смыв роста микроорганизмов с поверхности плотной питательной среды

В состав плотной высокотемпературной плазмы (“шлейфа”) не входят

• значениям молекулярных масс белков аналита;
• значениям молекулярных масс белков аналита и матрицы;
• масс-спектральным фингерпринтам эталонных штаммов микроорганизмов;
• смысловым пикам масс-спектрального фингерпринта;
• “шумовым” пикам масс-спектрального фингерпринта

Важнейшим достоинством микробиологического метода исследования является

Важнейшим из перечисленных недостатков микробиологического метода исследования является

• нейтроны;
• протонированные молекулы аналита;
• протонированные молекулы вещества матрицы;
• протонированные фрагменты молекул аналита;
• протонированные фрагменты молекул вещества матрицы;
• электроны

Важнейшими положительными результатами интегрирования MALDI-TOF MS-анализа в схему микробиологической диагностики являются

• возможность получения микроорганизма в жизнеспособном состоянии в форме чистой культуры;
• высокая специфичность;
• высокая чувствительность;
• короткие сроки выполнения диагностического исследования;
• низкая себестоимость;
• низкая трудоёмкость

Видовому уровню идентификации с высокой вероятностью соответствует значение индекса соответствия

• высокая себестоимость;
• недостаточная специфичность;
• недостаточная чувствительность;
• продолжительность выполнения;
• трудоёмкость

Время-пролёта сквозь времяпролётную трубу при прочих равных условиях определяется

• оптимизация сроков назначения эмпирической противомикробной химиотерапии;
• повышение уровня достоверности идентификации микроорганизмов;
• повышение уровня точности клинического диагноза;
• сокращение себестоимости диагностического исследования;
• сокращение сроков идентификации микроорганизмов

Десорбция означает

Диапазон масс, анализируемых современными времяпролётными лазерными ионизационно-десорбционными масс-спектрометрами, составляет

• ,000 – 1,699;
• 1,700 – 1,999;
• 2,000 – 2,299;
• 2,300 – 3,000;
• 3,000 – 3,2

Идентификация микроорганизмов осуществляется по масс-спектрам в диапазоне

• диаметром время-пролётной трубы;
• длиной время-пролётной трубы;
• значением отношения массы движущейся частицы к заряду (m/z);
• температурой время-пролётной трубы;
• ускоряющим потенциалом электростатического поля

Идентификация микроорганизмов с помощью MALDI-TOF MS -анализатора осуществляется путём сопоставления

• всасывание аналита электропроводным носителем;
• деионизацию протонированных молекул биополимеров;
• переход ионизированного аналита в газовую фазу, минуя жидкую;
• разрушение третичной структуры белковой молекулы;
• растворение аналита веществом матрицы

Избыточная толщина слоя аналита приводит к

• 100 Da – 100 kDa;
• 100 kDa – 200 kDa;
• 100 kDa – 500 kDa;
• 2 Da – 20 Da;
• 2 kDa – 20 kDa

Изолированная колония – это

Индекс соответствия (“score value”) – это

• 100 Da – 100 kDa;
• 100 kDa – 200 kDa;
• 100 kDa – 500 kDa;
• 2 Da – 20 Da;
• 2 kDa – 20 kDa

Ионизация приводит к

• белкового паттерна аналита с белковыми паттернами баз данных анализатора;
• белкового паттерна аналита с белковыми паттернами матрицы;
• результатов идентификации посредством MALDI-TOF MS с результатами идентификации с помощью биохимического анализатора;
• результатов идентификации посредством MALDI-TOF MS с результатами идентификации с помощью газовой хроматографии;
• результатов идентификации посредством MALDI-TOF MS с результатами идентификации с помощью микроскопии

К генотипическим методам идентификации микроорганизмов нельзя отнести

• высокому значению соотношения “сигнал-шум”;
• неудовлетворительной сокристаллизации с веществом матрицы;
• низкому значению соотношения “сигнал-шум”;
• разрушению вещества матрицы;
• разрушению материала электропроводного носителя

К методикам пробоподготовки для MALDI-TOF MS-анализа нельзя отнести

• клон микроорганизма на поверхности плотной питательной среды;
• произвольное скопление микроорганизмов на поверхности плотной питательной среды;
• рост микроорганизмов в ограниченном объёме жидкой питательной среды;
• содержимое ампулы вакцинного препарата;
• содержимое капсулы пробиотического препарата

Качество масс-спектра зависит от

Лазерное излучение характеризуется

• расчётная величина, отражающая значения m/z различных фрагментов аналита;
• расчётная величина, отражающая скорость перемещения фрагментов аналита во время-пролётной трубе;
• расчётная величина, отражающая степень ионизации фрагментов аналита;
• условный коэффициент, отражающий степень соответствия белкового паттерна опытного образца белковым паттернам эталонных штаммов базы данных;
• условный коэффициент, отражающий степень соответствия белковых паттернов фрагментов аналита белковым паттернам матрицы

Масс-спектр – это

• изменению первичной структуры белка;
• приданию электронейтральной молекуле заряда того или иного знака;
• укреплению связи аналита с электропроводным носителем;
• формированию дополнительных внутримолекулярных водородных связей;
• эмиссии электронов из аналита

Масс-спектральный фингерпринт – это

• анализ полиморфизма отдельных нуклеотидов;
• анализ случайной амплификации полиморфных фрагментов ДНК;
• мультилокусное секвенирование;
• полногеномное секвенирование;
• секвенирование генов 16S-РНК

Масс-спектрометрия – это метод разделения

• нанесение аналита с предшествующей обработкой муравьиной кислотой;
• нанесение аналита с предшествующей обработкой щавелевой кислотой;
• нанесение аналита с предшествующей экстракцией эфиром;
• нанесение аналита, суспендированного в фосфатном буфере;
• прямое нанесение аналита

Матрица обеспечивает

Микробиологическая диагностика не включает этап

• абсолютного количества аналита;
• концентрации вещества матрицы;
• равномерности распределения слоя аналита по поверхности носителя;
• соотношения количеств вещества аналита и вещества матрицы;
• типа матрицы;
• толщины слоя аналита

Необходимый и достаточный уровень идентификации микроорганизма (родовой, видовой, внутривидовой) определяется

• высокой частотой импульсации;
• когерентностью;
• низкой частотой импульсации;
• переменной длиной волны;
• фиксированной длиной волны

Ограничение в применении MALDI-TOF MS-анализа для идентификации вирусов обусловлено

• графическое отображение совокупности ионизированных молекул, разделённых по значениям отношения массы иона к его заряду;
• диаграмма, полученная с помощью хроматографии;
• кривая, описывающая распределение молекул в электрическом поле;
• совокупность полос, полученных в результате электрофоретического разделения продуктов амплификации;
• совокупность полос, полученных в результате электрофоретического разделения смеси белков

При бактериологической диагностике бактериемии MALDI-TOF MS — анализ может быть применён для изучения

• совокупный профиль пучка протонов, обладающих различной скоростью;
• совокупный профиль пучка электронов, обладающих различной скоростью;
• совокупный профиль фрагментов матрицы с различными значениями m/z;
• усреднённый индивидуальный профиль компонентов высокотемпературной плазмы с различными значениями m/z;
• усреднённый индивидуальный профиль компонентов высокотемпературной плазмы с различными значениями молекулярной массы

При бактериологической диагностике острого цистита MALDI-TOF MS-анализ может быть применён для изучения

При бактериологической диагностике сальмонеллёзного энтерита MALDI-TOF MS-анализ может быть применён для изучения

• аналита и матрицы;
• белков, полипептидов, олигопептидов;
• ионов по величинам m/z – отношения массы к заряду;
• молекул по молекулярным массам;
• низкомолекулярных и высокомолекулярных соединений

Рибосомные белки характеризуются

• поглощение квантов излучения лазера;
• поляризацию компонентов аналита;
• сокристаллизацию с фрагментами аналита;
• фрагментирование аналита;
• частичный лизис клеток микроорганизма

Собственные (“домашние”) базы данных конструируются путём внесения белковых паттернов

• анализ изолированных колоний;
• выделение чистой культуры;
• идентификация чистой культуры;
• консервация исследуемого биологического материала;
• посев исследуемого биологического материала

Сохранению нативной биологической структуры молекул способствует

• особенностями эпидемиологической ситуации в стационаре;
• требованиями действующих инструктивных документов;
• требованиями клинической целесообразности;
• уровнем вакцинации населения;
• уровнем знаний о биологии вида

Теоретические основы масс-спектрометрии заложены

Термин “MALDI-TOF MS” является аббревиатурой термина

• высокой молекулярной массой капсидных белков вирусов;
• высокой степенью патогенности вирусов;
• малыми абсолютными размерами вирусных частиц;
• отсутствием у вирусов митохондриальных белков;
• отсутствием у вирусов рибосомных белков

Целью клинической микробиологической диагностики является

• исследуемого биологического материала (крови);
• материала гемокультуры;
• материала изолированных колоний;
• материала препарата для биохимической идентификации;
• материала чистой культуры

Экстракция муравьиной кислотой позволяет

• исследуемого биологического материала (мочи);
• материала изолированных колоний;
• материала препарата для агглютинации специфическими антисыворотками;
• материала препарата для биохимической идентификации;
• материала чистой культуры

“Домашние” базы данных используются

• исследуемого биологического материала (фекалий);
• материала изолированных колоний;
• материала препарата для агглютинации специфическими антисыворотками;
• материала препарата для биохимической идентификации;
• материала чистой культуры

• высокой (более 100 kDa) молекулярной массой;
• высокой гидрофильностью;
• высокой консервативностью;
• способностью к эффективной сокристаллизации;
• умеренной гидрофобностью

• генетически идентифицированных микроорганизмов;
• достоверно идентифицированных микроорганизмов из сторонних баз данных;
• микроорганизмов, идентифицированных с помощью биохимических анализаторов;
• микроорганизмов, идентифицированных с помощью иммуноферментного анализа;
• микроорганизмов, идентифицированных с помощью электронной микроскопии

• гидролиз;
• жёсткая ионизация;
• лизис;
• мягкая ионизация;
• протеолиз

• Джозефом Томсоном;
• Львом Ландау;
• Нильсом Бором;
• Уинстоном Черчиллем;
• Эрнестом Резерфордом

• временная матрично-активированная лазерная ионизационно-десорбционная масс-спектрометрия;
• времяпролётная лазерно-активированная матричная ионизационно-десорбционная масс-спектрометрия;
• времяпролётная молекулярно-активированная лазерная ионизационно-десорбционная масс-спектрометрия;
• матрично-активированная времяпролётная лазерная ионизационная масс-десорбционная спектрометрия;
• матрично-активированная лазерная десорбционно -ионизационная времяпролётная масс-спектрометрия

• генотипирование выделенного микроорганизма;
• идентификация микроорганизма, ассоциированного с тем или иным исследуемым биологическим материалом;
• оценка эпидемиологической ситуации в стационаре;
• постановка клинического диагноза;
• развёртывание мероприятий по санитарной обработке помещений лечебного учреждения

• повысить степень связывания аналита с электропроводным носителем;
• повысить степень экстракции содержимого микробных клеток;
• повысить эффективность взаимодействия аналита с веществом матрицы;
• повысить эффективность ионизации;
• получить более высокое значение соотношения “сигнал-шум”;
• получить большее число смысловых пиков

• взамен базы данных биохимического анализатора;
• взамен собственной базы данных анализатора;
• наравне с базой данных биохимического анализатора;
• наравне с базой данных геномного секвенатора;
• наравне с собственной базой данных анализатора