Молекулярно-генетическая диагностика в подборе таргетной терапии онкологических заболеваний

BRCA1/2 – ассоциированные опухоли

Абсолютным показанием для проведения анализа генов BRCA1, BRCA2 при наличии диагноза рак яичников является

• нечувствительны к PARP-ингибиторам;
• нечувствительны к препаратам платины;
• чувствительны к PARP-ингибиторам;
• чувствительны к препаратам платины

Биоинформатический анализ данных секвенирования следующего поколения (NGS) включает в себя

• муцинозная карцинома яичников;
• светлоклеточная (мезонефроидная) карцинома яичников;
• серозная карцинома яичников;
• эндометриоидная карцинома яичников

В качестве потенциальных мишеней таргетной терапии не могут рассматриваться белки, которые

• аннотирование выявленных изменений;
• определение клинической значимости мутаций;
• подготовку библиотеки фрагментов ДНК;
• поиск изменений относительно референсного генома

Виды секвенирования следующего поколения (NGS

• отсутствуют в опухоли, но присутствуют в нормальных тканях;
• отсутствуют и в опухоли, и в нормальных тканях;
• присутствуют в опухоли, но отсутствуют в нормальных тканях;
• присутствуют и в опухоли, и в нормальных тканях

Для низкомолекулярных ингибиторов, применяемых в таргетной терапии опухолей, характерно связывание с мишенью

Доминирующей мутацией в 600-м кодоне гена BRAF при меланоме является

• геномное;
• протеомное;
• транскриптомное;
• экзомное

Задачи в онкологии, решаемые с помощью NGS-технологий

• в плазме крови;
• в синаптической щели;
• внеклеточно;
• внутриклеточно

К препаратам для таргетной терапии опухолей относятся

• V600D (Val600Asp);
• V600E (Val600Glu);
• V600R (Val600Arg);
• V600К (Val600Lys

К препаратам для таргетной терапии опухолей относятся

• определение белковых маркеров на поверхности клеток;
• определение молекулярного профиля опухолей;
• определение потенциальных мишеней для таргетной терапии;
• поиск наследственных мутаций, обуславливающих опухоль

К препаратам для таргетной терапии опухолей относятся

Классы точковых мутаций в генах, ассоциированных с онкологическими заболеваниями

• алкилирующие агенты;
• ингибиторы апоптоза;
• ингибиторы сигнальных путей;
• стабилизаторы микротрубочек

Количество экзонов в гене BRCA1

• алкилирующие агенты;
• ингибиторы ангиогенеза;
• ингибиторы сигнальных путей;
• стабилизаторы микротрубочек

Количество экзонов в гене BRCA2

• алкилирующие агенты;
• ингибиторы ангиогенеза;
• ингибиторы апоптоза;
• стабилизаторы микротрубочек

Материалом для генетического анализа может быть

• вероятно патогенная;
• несомненно патогенная;
• неясной значимости;
• химерная

Материалом для генетического анализа может быть

Материалом для генетического анализа может быть

• 1;
• 2;
• 24;
• 81

Материалом для тестирования мутаций гена EGFR могут быть

• 1;
• 2;
• 27;
• 82

Материалом для тестирования мутаций гена EGFR может быть

• биопсия опухоли;
• операционный материал;
• плазма крови;
• эритроцитарная масса

Материалом для тестирования мутаций гена EGFR может быть

• аспирационная биопсия;
• бронхоальвеолярный лаваж;
• экссудат;
• эритроцитарная масса

Материалы, пригодные для определения мутации в генах BRCA1/2

Метод молекулярно-генетической диагностики, наиболее чувствительный для детекции соматических мутаций

• браш-биопсия;
• бронхиальный смыв;
• мокрота;
• эритроцитарная масса

Методы молекулярно-генетической диагностики, не позволяющие выявлять точковые соматические мутации

• плазма крови;
• сыворотка крови;
• циркулирующие опухолевые клетки;
• эритроцитарная масса

Методы тестирования EGFRнагистологическом и цитологическом материале

• биопсия;
• бронхиальный смыв;
• операционный материал;
• эритроцитарная масса

Методы тестирования гена BRAF

• аспирационная биопсия;
• браш-биопсия;
• буккальный эпителий;
• мокрота

Методы, применяемые для BRCA-тестирования

Молекулярно-генетические методы диагностики в онкологии

• биопсийный материал;
• образец опухоли;
• операционный материал;
• эритроцитарная масса

Молекулярно-генетические методы диагностики в онкологии

• микросателлитный анализ;
• секвенирование нового поколения;
• секвенирование по Сенгеру;
• хромосомный микроматричный анализ

Мутации гена BRAF на поздних стадиях меланомы

• микросателлитный анализ;
• секвенирование нового поколения;
• секвенирование по Сенгеру;
• хромосомный микроматричный анализ

Наиболее распространённый тип крупных перестроек генов BRCA1 и BRCA2

• аллельспецифическая ПЦР;
• высокоразрешающее плавление (HRM);
• секвенирование ДНК;
• флуоресцентная гибридизация in situ

Наиболее редкий тип мутаций в гене BRCA1 в европейских популяциях

Наиболее частый тип мутаций в гене BRCA1 в европейских популяциях

• аллельспецифическая ПЦР;
• высокоразрешающее плавление (HRM);
• секвенирование ДНК;
• электронная микроскопия

Наименьшее число ложноотрицательных результатов достигается при молекулярно-генетическом исследовании опухолевого материала в виде

• высокоразрешающее плавление (HRM);
• секвенирование ДНК по Сэнгеру;
• секвенирование ДНК следующего поколения;
• флуоресцентная гибридизация in situ

Ограничения применения NGS в клинической практике

• аллельспецифическая ПЦР;
• высокоразрешающее плавление (HRM);
• иммуногистохимия;
• секвенирование ДНК по Сэнгеру

Около половины случаев серозного высокозлокачественного рака яичников обусловлено мутациями генов, задействованных в репарации ДНК путём

• анализ конформационного полиморфизма одноцепочечной ДНК;
• анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов;
• цифровая ПЦР;
• электронная микроскопия

Подавляющее большинство мутаций в гене BRAF при меланоме затрагивают

Потенциальными мишенями таргетной терапии могут быть белки, которые

• ассоциируются с благоприятным прогнозом;
• ассоциируются с инволюцией опухоли;
• ассоциируются с неблагоприятным прогнозом;
• не выявляются по техническим причинам

При меланоме кожи наиболее часто соматические мутации выявляются в генах

• амплификации;
• делеции;
• дупликации;
• трипликации

При серозном раке яичников мутации наиболее часто выявляются в генах

• миссенс;
• нонсенс;
• сдвиг рамки считывания;
• сплайсинг

При увеальной меланоме наиболее часто соматические мутации выявляются в генах

• миссенс;
• нонсенс;
• сдвиг рамки считывания;
• сплайсинг

Пути репарации ДНК

Селективный ингибитор BRAF киназы блокирует мутантную форму белка BRAF, тем самым

• бронхоальвеолярного лаважа;
• операционного материала;
• пукционной аспирационной биопсии;
• циркулирующих опухолевых клеток

Таргетная терапия направлена против

• в России нет регистрационных удостоверений для большинства приборов и реактивов;
• в мире не существуют общепринятых критериев и инструкций по применению;
• невозможность выявления генетических вариантов в образце опухолевого материала;
• сложность интерпретации генетических вариантов с недоказанной клинической значимостью

Типы повреждений ДНК

• вырезания азотистого основания;
• вырезания нуклеотида;
• гомологичной рекомбинации;
• метилирования ДНК

Этапы проведения секвенирования следующего поколения (NGS) для диагностики в онкологии

• 400-й кодон;
• 500-й кодон;
• 600-й кодон;
• 700-й кодон

• отсутствуют в опухоли, но присутствуют в нормальных тканях;
• отсутствуют и в опухоли, и в нормальных тканях;
• присутствуют в опухоли, но отсутствуют в нормальных тканях;
• присутствуют и в опухоли, и в нормальных тканях

• BRAF;
• FMR1;
• NRAS;
• UBE3A

• BRAF;
• BRCA1/2;
• EMSY;
• PTEN

• FMR1;
• GNA11;
• GNAQ;
• UBE3A

• гомологичное рекомбинантное восстановление;
• негомологичное конечное присоединение;
• ферментативное алкилирование гуанина;
• ферментативное метилирование цитозина

• активируя деление клеток;
• индуцируя апоптоз, приводящий к гибели клетки;
• селективно ингибируя рост и пролиферацию;
• угнетая клеточный цикл

• молекул комплекса репликации ДНК;
• определенных молекулярных мишеней;
• опухолей определенного возраста;
• опухолей определенных органов

• алкилирование гуанина;
• двунитевые разрывы;
• метилирование цитозина;
• однонитевые разрывы

• анализ данных;
• подготовка библиотеки;
• рестрикционный анализ;
• секвенирование