Генетическая диагностика первичных иммунодефицитных состояний

• Аутосомно-доминантный тип наследования:

• мать носитель мутантного аллеля;
• оба родителя больны;
• оба родителя носители мутантного аллеля;
• один из родителей носитель мутантного аллеля

• Аутосомно-рецессивный тип наследования:

• мать носитель мутантного аллеля;
• оба родителя больны;
• оба родителя носители мутантного аллеля;
• один из родителей носитель мутантного аллеля

• В чём преимущество прямого секвенирования по Сенгеру?

• невозможность определения крупных делеций;
• невозможность определения мутаций сайтов сплайсинга;
• низкая пропускная способность;
• низкий уровень ошибок

• Врождённые мутации:

• возникают в течение жизни;
• герминальные;
• локализуются в половых клетках;
• передаются по наследству;
• соматические

• Для каких целей определяют генетический дефект у пациентов с ПИДС?

• для выявления родственников с субклиническими формами течения ПИДС;
• для использования специфических препаратов в лечении пациента;
• для поиска родственного донора;
• для проведения пренатальной диагностики

• Из чего состоит ген?

• домены;
• интроны;
• хромосомы;
• экзоны

• Иммунодефициты с гипофункцией белка:

• Дефицит PI3 киназы (ген PI3KR1);
• Дефицит STAT1 (ген STAT1);
• Синдром Вискотта-Олдрича (ген WAS);
• Х-сцепленный лимфопролиферативный синдром (ген BIRC4

• Иммунодефициты с избыточной функцией белка:

• Активированная PI3K? (ген PIK3 p110);
• Семейная средиземноморская лихорадка (ген MEFV);
• Х-сцепленная нейтропения (ген WAS

• Как интерпретируют мутации по степени патогенности при оценке результатов NGS?

• вероятно патогенные;
• гетерозиготные;
• патогенные;
• хромосомные

• Как классифицируются мутации по степени патогенности при интерпретации результатов NGS?

• Вероятно доброкачественные;
• Вероятно патогенные;
• Доброкачественные;
• Неясного значения;
• Патогенные

• Какие панели генов могут использоваться при NGS у пациентов с ПИДС?

• полногеномное секвенирование;
• полноэкзомное секвенирование;
• таргетные панели ПИДС

• Кого из родственников необходимо обследовать при АД ПИДС в семье?

• кровных родственников пробанда;
• мать пробанда при беременности;
• родителей пробанда;
• сиблингов пробанда

• Кого из родственников необходимо обследовать при АР ПИДС в семье?

• кровных родственников пробанда;
• мать пробанда при беременности;
• родителей пробанда;
• сиблингов пробанда

• Кого из родственников необходимо обследовать при Х-сцепленном ПИДС в семье?

• мать пробанда при беременности;
• сестёр матери пробанда;
• сестёр отца пробанда;
• сестёр пробанда

• Компаунд гетерозиготная мутация встречается при:

• Х-сцепленном наследовании;
• аутосомно-доминантном наследовании;
• аутосомно-рецессивном наследовании;
• при любом типе наследования

• Методы генетической диагностики ПИДС:

• иммуноферментный анализ (ИФА);
• прямое секвенирование по Сенгеру;
• секвенирование нового поколения (NGS);
• хромосомный микроматричный анализ

• Миссенс-мутации приводят к:

• замене аминокислоты;
• изменению смысла кодона;
• образованию бессмысленного стоп-кодона;
• остановке синтеза белка

• Мутации de novo характеризуются:

• изменениями ДНК в оплодотворённой яйцеклетке;
• изменениями ДНК в сперматозоидах;
• изменениями ДНК в яйцеклетках

• Мутации могут:

• полностью изменять свойства белка;
• приводить к остановке синтеза белка;
• усиливать активность белка

• Мутации при аутосомно-доминантном типе наследования:

• гетерозиготные;
• гомозиготные;
• компаунд гетерозиготные

• Недостатки использования таргетных панелей:

• быстрое устаревание панелей;
• дорого в использовании;
• дёшево в использовании;
• сложность интерпретации результатов

• Нонсенс-мутации приводят к:

• замене аминокислоты;
• изменению смысла кодона;
• образованию бессмысленного стоп-кодона;
• остановке синтеза белка

• Определение точного генетического дефекта необходимо для назначения пациенту с ПИДС:

• ВВИГ;
• генной терапии;
• противомикробной терапии;
• таргетных препаратов;
• трансплантации гемопоэтических стволовых клеток

• ПИДС с Х-сцепленным типом наследования:

• IPEX-синдром (с мутацией в FOXP3);
• Синдром Вискотта-Олдрича (с мутацией в WAS);
• Х-сцепленная ХГБ (с мутацией в CYBB);
• Х-сцепленная агаммаглобулинемия (с мутацией в BTK

• ПИДС с аутосомно-доминантным типом наследования:

• Аутоиммунный лимфопролиферативный синдром (с мутацией в гене FAS);
• Гипер IgE синдром (с мутацией в гене STAT3);
• Криопирин-ассоциированый синдром (с мутацией в гене NLRP3);
• Наследственный ангионевротический отёк (с мутацией в гене SERPING1);
• Тяжёлая врождённая нейтропения (с мутацией в ELANE

• ПИДС с аутосомно-рецессивным типом наследования:

• ГиперIgD синдром (с мутацией в гене MVK);
• Синдром Луи-Барр (мутацией в гене ATM);
• Синдром Ниймеген (с мутацией в гене NBS1);
• Тяжёлая врождённая нейтропения (с мутацией в HAX1

• Перспективы генетической диагностики ПИДС:

• доступность методов;
• изучение влияния соматических мутаций на фенотип;
• изучение эпигенетических влияний;
• простота анализа данных

• Преимущества метода секвенирования нового поколения (NGS):

• возможность поиска мутаций при ПИДС без чёткого клинического фенотипа;
• относительно дешёвая технология;
• позволяет выявлять соматические мутации;
• позволяет одновременно секвенировать большое число образцов;
• позволяет определять крупные делеции

• Преимущество использования полногеномного секвенирования:

• возможность выявления всех дефектов;
• возможность выявления только дефектов генов ПИДС;
• дорого в использовании;
• сложность интерпретации результатов

• Преимущество использования полноэкзомного секвенирования:

• возможность выявления мутаций в интронах;
• возможность выявления новых генов заболеваний;
• возможность выявления соматических мутаций;
• сложность интерпретации результатов

• При каких ПИДС оправдано использование метода прямого секвенирования по Сенгеру?

• при ПИДС с тяжёлым клиническим фенотипом;
• при ПИДС с чётким клиническим фенотипом

• При неполной пенетрантности гена:

• Встречается при аутосомно-доминантном типе наследования;
• Фенотип проявляется не полностью при наличии генетического дефекта;
• Фенотип проявляется не проявляется при наличии генетического дефекта

• При проведении пренатальной диагностики ДНК плода получают из:

• амниотической жидкости;
• ворсин хориона;
• крови матери;
• крови отца

• Приобретённые мутации:

• возникают в течение жизни;
• герминальные;
• локализуются в половых клетках;
• передаются по наследству;
• соматические

• Секвенирование нового поколения (NGS):

• позволяет выявлять соматические мутации;
• позволяет определять крупные делеции;
• позволяет секвенировать большое число образцов;
• современный метод поиска мутаций

• Типы наследования ПИДС:

• Аутосомно-доминантный;
• Аутосомно-рецессивный;
• Х-сцепленный доминантный;
• Х-сцепленный рецессивный

• Х-сцепленный тип наследования:

• мать носитель мутантного аллеля;
• оба родителя больны;
• оба родителя носители мутантного аллеля;
• один из родителей носитель мутантного аллеля

• Цели генетической диагностики:

• определение прогноза течения заболевания;
• определение тактики ведения пациента;
• подтверждение диагноза;
• проведение пренатальной диагностики;
• семейное консультирование

• Что влияет на фенотип ПИДС?

• гены-модификаторы;
• соматические мутации;
• факторы окружающей среды;
• эпигенетические факторы